La programmation des Journées Européennes du Patrimoine occupe une place importante dans le calendrier des Petites Cités. En 2008, l'association a élaboré pour la première fois un document unique regroupant toutes les animations et visites ouvertes dans les PCCC les 20 et 21 septembre 2008. Il a été distribué sur Besançon et dans toute la Région Franche-Comté à travers les communes et Offices du Tourisme, partenaires de l'association.
Un programme 2009 des Journées du Patrimoine en Petites Cités Comtoises de Caractère a été élaboré pour les 19 et 20 septembre 2009 en partenariat avec la DRAC Franche-Comté. Il est téléchargeable en cliquant sur le lien suivant. Voir également le site de la DRAC Franche-Comté.
